Les étudiantes et les étudiants inscrits à un programme de cycles supérieurs à l'Université de Moncton sont admissibles aux bourses offertes par des organismes tels le Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie (CRSNG), le Conseil de recherches en sciences humaines (CRSH), les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), les différents ministères gouvernementaux, les compagnies et les organisations nationales et internationales. Des bourses de l'Université sont également disponibles. On peut obtenir des renseignements sur ces différentes bourses en s'adressant à la Faculté des études supérieures et de la recherche ou au Service des bourses et de l'aide financière du Campus de Moncton.
Des comités de sélection, homologués par la Faculté des études supérieures et de la recherche, font chaque année la sélection des candidates et des candidats méritants pour les bourses du CRSNG, du CRSH, des IRSC et de cycles supérieurs de l'Université de Moncton.